في اطار رسالة كلية الزراعة والموارد الطبيعية – جامعة أسوان يلتزم قسم بأعداد الخريجين متميزين علميًا وعمليًا لمجابهة احتياجات سوق العمل المحلي واستخدام الميكروبيولوجيا التطبيقية و المعالجة البيولوجية و التكنولوجيا الحيوية في الحد من التلوث البيئي والأستدامة البيئية وتنمية المجتمع المحلي.