ثانياً: برامج الماجستير المهني
تمنح جامعة أسوان بناءاً علي إقتراح مجلس كلية الزراعة والموارد الطبيعية درجة الماجستير المهني وذلك في 13 برنامج تخصصي تمنحها الأقسام العلمية.
| م | برامج الماجستير المهني | القسم العلمي |
| 1 | استصلاح واستزراع الأراضي الصحراوية | الأراضي والموارد الطبيعية الزراعية |
| 2 | تكنولوجيا الأغذية | علوم وتكنولوجيا الأغذية |
| 3 | التغذية العلاجية | علوم وتكنولوجيا الأغذية |
| 4 | تكنولوجيا الألبان | علوم وتكنولوجيا الألبان |
| 5 | دراسة الجدوي الاقتصادية للمشروعات الزراعية | الاقتصاد والارشاد الزراعي |
| 6 | الإرشاد الزراعي | الاقتصاد والارشاد الزراعي |
| 7 | تربية ورعاية الحيوانات والدواجن في المناطق الحارة وشبه الحارة | الانتاج الحيواني والداجني |
| 8 | تكنولوجيا انتاج الحاصلات البستانية للتصدير | البساتين |
| 9 | إنتاج المحاصيل | المحاصيل |
| 10 | التكنولوجيا الحيوية | الميكروبيولوجيا الزراعية
الوراثة الكيمياء الحيوية الزراعية |
| 11 | تربية وإنتاج نحل العسل | وقاية النبات |
| 12 | مكافحة آفات النخيل وإنتاج التمور النظيفة | |
| 13 | التقنيات الحديثة في الهندسة الزراعية | الهندسة الزراعية والنظم الحيوية |