يسعى قسم أمراض النبات أن يكون متميزاً و رائداً في البحوث والتدريس والإرشاد في مجال أمراض النبات وتطبيقاتها على المستوى المحلي والإقليمي.
إعداد وتخريج كوادر ذوى كفاءة عالية من المهندسين الزراعيين والباحثين القادرين على العمل فى مجال تشخيص ومقاومة الأمراض النباتية وحل المشاكل المتعلقة بها ، كما يقوم القسم بالأشراف على طلاب الدراسات العليا وتأهيلهم للحصول على درجتي الماجستير والدكتوراه فى مجال أمراض النبات، كما يقوم القسم بإجراء البحوث التطبيقية لحل المشاكل المرضية.
1- تأهيل وإعداد الطلاب للحصول على درجة البكالوريوس فى العلوم الزراعية (تخصص أمراض النبات ) وإكسابهم المعارف والمهارات وتدريبيهم بما يلبى متطلبات سوق العمل.
2 – تأهيل طلاب الدراسات العليا للحصول على درجتى الماجستير والدكتوراه فى مجال أمراض النبات بما يتوافق مع التطور والتقدم فى مجال البحث العلمي.
3 – مواكبة التطورات في برامج التعليم لمرحلة البكالوريوس والدراسات العليا لإعداد خريجين قادرين على مسايرة التكنولوجيا الحديثة في تطبيقات أمراض النبات.
4- القيام بإجراء البحوث العلمية والتطبيقية التى تهتم بحل المشاكل المرضيه الموجوده فى البيئة المحيطة و العمل على إيجاد بدائل للمكافحة الكيميائية للحد من تلوث البيئة وإنتاج الغذاء الآمن.
5- عمل قنوات تعاون بين القسم و المراكز البحثية وكذلك الجامعات الأخرى فى مجال أمراض النبات.