يهتم قسم الميكروبيولوجيا الزراعية  بتدريس المفاهيم الأساسية العامة لعلم الميكروبيولوجي  للطلاب وكذلك الدور التطبيقى للميكروبات في تدوير المخلفات ومعالجة التلوث البيئى والمحافظة على البيئة وايضاً دور التكنولوجيا الحيوية فى إنتاج المخصبات والمبيدات الحيوية.

:رؤية القسم

يسعى قسم الميكروبيولوجيا الزراعية خلال العقد القادم بأن يصبح من الأقسام المتميزة علميأ على المستوى المحلى والأقليمى لخدمة أهداف تنمية البيئة والمحافظة عليها .