يهدف البرنامج إلى تنمية قدرات و معارف و فهم الطالب لبرنامج الكيمياء الحيوية الزراعية وعلاقته بالإنتاج و الكيان الزراعي عامة كما يهتم القسم بإعداد خريج متميز متخصص في مجال التحاليل الحيوية والتحاليل الكيميائية للأغذية بما يحقق متطلبات سوق العمل في مجال التحكم في  مواصفات جودة المنتج في المصانع المختلفة .